Abstract:
En este proyecto, se desarrolló y validó un pipeline bioinformático destinado a la identificación
de genes de resistencia a antibióticos en bacterias, particularmente, aquellas que
forman parte de la dieta de Ceratitis capitata. La necesidad de este pipeline surge de la
urgencia de comprender y mitigar los riesgos asociados con la liberación de insectos que
pueden portar bacterias resistentes a antibióticos, lo que tiene implicaciones significativas
para la salud pública.
El pipeline se diseñó para ser accesible y fácil de usar, permitiendo que usuarios sin
conocimientos avanzados en bioinformática puedan operarlo. Utiliza herramientas estándar
de bioinformática como fastp y SPAdes para procesar secuencias de ADN; y está equipado
para proporcionar, no solo identificaciones de genes de resistencia, sino también información
detallada sobre el genoma a lo largo de cada etapa de análisis.
Se validó utilizando un protocolo basado en el modelo de Neisseria meningitidis, empleando
métricas como exactitud, precisión, sensibilidad y especificidad, las cuales demostraron
la efectividad del pipeline al identificar los genes de resistencia. La aplicación del
pipeline a muestras reales reveló la presencia de múltiples genes de resistencia, subrayando
su relevancia y utilidad práctica. (LA)
