Estudio comparativo y propuesta de un método molecular de bajo costo para el pronóstico de la respuesta al tratamiento de Interferón alfa y Ribavirina en pacientes con hepatitis C - efecto de la homología IL28B-IL28A en la genotipificación del polimorfismo de un solo nucleótido rs12979860.

Abstract

La farmacología de la Hepatitis C es un paso clave en el tratamiento efectivo de la enfermeda, ya que permite orientar al médico respecto al régimen y fármaco apropiados para el paciente según su disposición genética y la del virus que le infecte. Por esta razón en los últimos años se han realizado varias publicaciones implementando la genotipificación del SNP rs12979860 - ligado al porcentaje de éxito del tratamiento con Interferón alfa pegilado y Ribavirina en pacientes con hepatitis C - por distintos métodos, pero no es hasta el año 2012 donde se determina por primera vez la existencia de una región homóloga a la que contiene el SNP rs12979860 y su impacto en el resultado de dicha genotipificación. El objetivo de este estudio fue realizar una evaluación de esta homología y de las publicaciones que se han producido respecto a la genotipificación de dicho SNP mediante herramientas bioinformáticas para diseñar y elegir un método de genotipificación de alta especificidad que sea conveniente para la población guatemalteca. Los resultados obtenidos evidencian que el método óptimo para la implementación de la genotipificación del SNP rs12979860 es el PCR multiplex alelo específico con los iniciadores 5' GGAAGGAAGCAGTTGCGCTG-3, 5' - CTTCACGCTCCGAGCATTGC-3, 5' AGCTCCCCGAAGGCGTG-3' y 5' - GTGCAATTCAACCCTGGTTCGC-3. Sin embargo, es necesario evaluar este método empíricamente para establecer su eficiencia como diagnóstico de la farmacogenética de la hepatitis C. RR