Implementación de análisis metagenómico utilizando hipertensión como caso de estudio.

Abstract

En el siguiente documento se presenta la información necesaria para llevar a cabo la implementación de un análisis metagenómico utilizando datos obtenidos de muestras del microbioma del intestino humano con el propósito de conocer si es posible determinar aso-ciación entre el microbioma y la hipertensión. El objetivo principal del análisis metagenómico fue obtener microorganismos o familias de genes que se encuentran correlacionados positiva o negativamente a la enfermedad, así como obtener las familias de proteínas que se encuentran en mayor abundancia para ambos tipos de muestras. La importancia de este estudio radica principalmente en que la hipertensión es una enfer-medad que afecta a una gran proporción de la población no solo en Guatemala si no a nivel mundial, por lo que conocer a mayor profundidad los factores de riesgo de padecer esta en-fermedad es de relevancia para su continuo estudio, supervisión y desarrollo de tratamientos con mayor efectividad. Las herramientas bioinformáticas permiten realizar un análisis de conjuntos extensos de datos como lo son los datos obtenidos de secuenciación de metagenómica. Además, el uso de modelos de machine learning mejora el proceso de predicción en la asociación de microbiomas y fenotipos presentes en el húesped. Por lo que en este documento se describe la metodología que se utilizó para el análisis de los datos de metagenoma del microbioma intestinal, las herramientas utilizadas en el flujo de trabajo del análisis de datos y cómo posteriormente se utilizó un modelo de machine learning para describir su asociación a la hipertensión. Así mismo, se describen hallazgos relevantes en cuanto a los resultados de las familias de proteínas y organismos más abundantes. (A)