Optimización de extracción de ADN y amplificación de los marcadores universales 16S y 18S ADNr para código de barras de ADN de microorganismos presentes en el Lago de Atitlán, Sololá y en un humedal artificial en El Progreso, Guatemala.

Abstract

Las microalgas, procariota y eucariota tienen una amplia variedad de aplicaciones en biotecnología, alimentos, energía y agricultura. Suelen estar en exceso en diferentes cuerpos de agua naturales altamente contaminados por incremento de nutrientes. Asimismo, tienen un rol importante en la remediación de aguas residuales a través de sistemas de tratamiento de agua, por ejemplo, humedal artificial. El objetivo de este estudio fue desarrollar un método molecular para la identificación de microalgas presentes en un humedal artificial (Sanarate) y en el Lago de Atitlán (Sololá). Para esto se realizó extracción de ADN de muestras frescas y congeladas por el método de fenol:cloroformo:alcohol isoamílico (25:24:1), amplificación de los marcadores universales 16S (cianobacterias) y 18S ADNr (eucariotas) y análisis de patrones de restricción por digestión enzimática de los amplicones con RSAI. Además, se realizó caracterización microscópica en muestras fijadas en lugol 2% y se cuantificaron con cámara de Neubauer. Se obtuvo amplificación de los dos marcadores universales en las muestras analizadas, sugiriendo presencia de microalgas de ambos orígenes. También se determinó diferencia en los patrones de restricción entre las muestras del humedal artificial y del Lago de Atitlán. Por último, en el humedal artificial se identificó morfológicamente (hasta género) y se encontró en mayor cantidad: Chlorella 44%, Euglena 8% y de morfología filamentosa 5% como Spirogyra sp. y Wilmottia sp. entre otras en muestras del humedal artificial. A partir de estos resultados se puede continuar con el desarrollo de un método molecular óptimo y más rápido para identificación de microalgas. También se sugiere el aprovechamiento de Euglena sp. y Spirogyra sp. para la producción de biocombustibles debido a su amplia aplicación en biotecnología.