Implementación de una prueba de RT-qPCR para la detección y monitoreo del Cucurbit yellow stunting disorder virus (CYSDV) en cultivos de cucúrbitas de interés comercial en Guatemala.

Abstract

El Cucurbit yellow stunting disorder virus (CYSDV por sus siglas en inglés), o el virus del trastorno del retraso del crecimiento amarillo de las cucurbitáceas, es un patógeno transmitido por el vector Bemisia tabaci que afecta a cultivos de melón, sandía y pepino a nivel mundial. Este es de rápida diseminación, y al ser uno de los principales virus patógenos de las cucurbitáceas, requiere de métodos de detección rápidos que permitan identificar al virus y tomar medidas preventivas y de control para evitar pérdidas comerciales y económicas. El presente estudio consistió en el desarrollo de una prueba de diagnóstico rápido mediante la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real con transcripción reversa (RT-qPCR) de tipo TaqMan® para identificar la presencia del CYSDV en cultivos nacionales, y realizar el monitoreo de este. Se diseñaron y validaron los cebadores y la sonda necesarios para detectar el gen asociado a la proteína de la cápside del virus, y se optimizó tanto la temperatura de anillamiento de la prueba, como la concentración de reactivos a emplear. Se estableció la prueba de detección del CYSDV, cuya validación presentó una eficiencia de entre 97.62 y 99.45%, así como un límite de cuantificación de 4.27x10-5ng. Del monitoreo del virus se demostró que el 92.16% de las muestras analizadas fueron positivas para el CYSDV, las cuales representan a los departamentos productores de cucúrbitas, en las regiones central, nororiente, suroriente y suroccidente de Guatemala. Con la prueba establecida, es posible realizar monitoreos constantes del virus en el país para tomar medidas preventivas, con las cuales se minimicen los efectos adversos del vector y se recupere la productividad agrícola al reducir la pérdida de cultivos afectados por el virus. (A)