Análisis filogenético de Begomovirus identificados en diferentes localidades y cultivos de Guatemala.

Abstract

Se realizó el análisis filogenético de diferentes muestras de Begomovirus (Geminiviridae) con datos de secuencias almacenadas provenientes de colectas llevadas a cabo en diferentes cultivos en Guatemala en diferentes localidades, por miembros del Laboratorio de Protección Vegetal en el Centro de Estudios Agrícolas y Alimentarios de la Universidad del Valle de Guatemala. Estas secuencias se analizaron utilizando el programa DNAstar con un segmento del componente A de las muestras de Begomovirus que incluye la región común (RC) y parte del gen de la proteína de la cápside (CP) del virus. Se elaboró un árbol filogenético para establecer las relaciones existentes entre los diferentes Begomovirus encontrados en los diferentes cultivos y localidades, identificando la presencia de “Tomato Mosaic Havana Virus” (TMHV) y “Pepper Huasteco Yellow Vein Virus” (PHYVV) dentro de las muestras analizadas, también se encontró una alta probabilidad de que exista la presencia de “Tomato Leaf Curl Sinaloa Virus” (TLCSV), “Bean Golden Mosaic Virus” (BGMV) y Melon chlorotic leaf curl virus” (MCLF). Además, se generó una guía sobre el uso de este programa para su futura utilización en los laboratorios de Protección Vegetal. Esta herramienta será muy útil para estudios de diversidad y para diagnóstico e identificación de diferentes entidades de interés y sobre todo para su diferenciación de otras especies muy similares o en casos en que se sospeche la presencia de alguna especies o biotipo nuevo para el país. (A)