Análisis in silico de péptidos estructurales de SARS-CoV-2. Estudio de prueba de concepto para el diseño de pruebas antígeno-anticuerpo.

Abstract

El desarrollo de pruebas rápidas basadas en las interacciones antígeno-anticuerpo se ha vuelto una necesidad que se ha incrementado con la pandemia de COVID-19. Actualmente son diversas entidades las que se dedican al desarrollo de estos métodos de detección. A pesar de la creciente necesidad, existe una escasa participación en Guatemala para el desarrollo de productos basados en la expresión de proteínas recombinantes, lo que representa un rezago en la creación de nuevos servicios y productos biotecnológicos. Por estos motivos, en el presente estudio se plantea una metodología bioinformática para la selección in silico de epítopos candidatos con potencial aplicación como método de diagnóstico. Asimismo, se propone el diseño de un vector que emplee Saccharomyces cerevisiae como sistema de expresión para la producción de epítopos de SARS-CoV-2, así como un SOP de transformación. Los resultados del estudio demuestran que los péptidos candidatos tienen altos índices de inmunogenicidad, conservación entre cepas y alta cobertura poblacional, por lo que resultan prometedores para su empleo como biomarcadores de diagnóstico. Adicionalmente, se demostró que es posible transformar S. cerevisiae con el SOP evaluado. Estos datos en conjunto presentan una propuesta viable para que en un futuro pueda ejecutarse el proceso de clonación, transformación y producción de epítopos recombinantes para que puedan utilizarse para la detección de anticuerpos séricos. (A)